I'm going to go ahead and guess you took the boat from Vermilion city to the Hoenn region. Don't worry, your Pokemon did not vanish they were placed in your pc. You'll need to play through the Hoenn story line until you reach Slateport city and take the ferry back to the Kanto region.
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Je vais aller de l'avant et devinez vous avez pris le bateau de Vermilion ville pour la région Hoenn . Ne vous inquiétez pas , vos Pokémon n'a pas disparu , ils ont été placés dans votre PC . Vous aurez besoin de jouer à travers la ligne d'histoire Hoenn jusqu'à Slateport ville et prendre le ferry pour la région de Kanto .